Убежище — центральный хаб, куда спасательная капсула приносит Хью и Диану в первой серии. Это бункер с верстаками, терминалами и большим 3D-принтером, который печатает оружие и модули.

Поначалу база работает на резервных батареях, и только перезагрузка электростанции оживляет принтер и терминалы модификации. Ключи доступа с поверженных боссов поднимают уровень Убежища и открывают новые ветки улучшений.

Здесь живёт торговец-Кубик, который продаёт костюмы и модули и рассказывает о роботах Идуса, а собранные НЗИ складываются в голографические сцены посреди комнаты.

Терминал виртуальных тренировок даёт испытания с оценками до трёх звёзд — и хорошие награды за них. Под Убежищем скрыта лаборатория прагматики.